今日新台币兑换日元汇率为：1新台币等于5.01687日元（1 TWD = 5.01687 JPY），那么5039新台币可以兑换成多少日元呢？我们可以用以下公式进行计算：
5039 日元 * 5.01687 新台币 / 1 日元 = 25279.983 新台币
所以，根据汇率可以算出5039新台币可兑换25279.98日元，即5039新台币等于25279.98日元（5039 TWD = 25279.98 JPY）。但需要注意此计算结果仅供参考，实际兑换请以银行实际交易成交价为准。
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